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ISOFORM是一个由两个单词(ISomer and FORM)组成的缩写词,代表“同一基因的不同形态”,而通常是由剪切变异(splicing)、多聚化、转录后修饰等引起的基因表达变化所引起的。在生物学中,isoform概念起源于基因表达的多态性,尤其是在基因剪切的背景下,一个基因可以产生许多不同的mRNA序列,每一个序列都对应一种isoform。
以下是关于isoform的三个方面的说明:
1.生物学角度
Isoform是指同一个基因内部的RNA分子可以有不同的切割方式(即多个可变区域的可变剪切),从而产生多种长度不同的mRNA分子,这些分子形态或功能不同,被称为isoform。在生物体内,不同的isoform可以具有不同的生物学功能和调控机制。
例如:
(1)人类激素受体基因的不同剪切变异(isoform)可以影响受体的功能和稳定性。
(2)虫白基因的多个可变剪切位点能产生多个不同长度的mRNA分子,从而编码出多种不同的白。
2.疾病研究角度
Isoform的表达与疾病的发病有关,例如肿瘤、心脏病、神经退行性疾病等,这些疾病的发病机制中多种isoform的异常表达或功能调控失常与之相关,因此,研究isoform在疾病生物学中的作用具有重要意义。
例如:
(1)研究发现甲基化、可变剪接、拷贝数变异等是人类自闭症的病因之一。
(2)心脏组织中isoform的变化被认为是心肌病的重要病因。
3.基因组学角度
Isoform的存在是基因组学研究中的一个难点,对于基因本身识别、定量和注释的精度有很大的影响,同时也给基因组学注释带来了挑战。
例如:
(1)在某些基因注释过程中,基于计算机的单个基因不足以表达基因不同的isoform。
(2)当新的数据被发现时,研究者需要重新评估已有的isoform注释。
以下是五个中英文例句:
1. The transcriptional complexity of the human genome is increased by alternative splicing, which generates multiple isoforms of each gene. (人类基因组的转录复杂性由可变剪切引起,该过程能为每个基因产生多种isoform。)
2. The isoform-specific activity of the ATR kinase and its role in DNA damage responses. (ATR激酶的isoform特异性活性及其在DNA损伤反应中的作用。)
3. Detection and ysis of alternative splicing isoforms from RNA-Seq data. (从RNA-Seq数据中检测和分析可变剪切isoform。)
4. Overexpression of an N-terminally truncated isoform of the iron-sulfur subunit of succinate dehydrogenase in human tumors. (人类肿瘤中铁硫亚单元的N末端截短isoform的过度表达。)
5. The diversity of plant growth and development is largely determined by the spatiotemporal expression of isoform-specific transcription factors. (植物生长和发育的多样性主要由isoform特异性转录因子的时空表达决定。)
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